印花税，
投资者在买卖成交后支付给财税部门的税收。上海
股票及深圳股票均按实际成交金额的千分之四支付，此税收由
券商代扣后由交易所统一代缴。债券与
基金交易均免交此项税收。
过户费，这是指股票成交后，更换户名所需支付的费用。由于我国两家交易所不同的运作方式，上海股票采取的是“中央登记、统一托管”，所以此费用只在投资者进行上海股票、基金交易中才支付此费用，深股交易时无此费用。此费用按成交股票数量（以每股为单位）的千分之一支付，不足1元按1元收。
转托管费，这是办理深圳股票、基金转托管业务时所支付的费用。此费用按户计算，每户办理转托管时需向转出方券商支付30元。
为何办理指定交易
由于沪市股票由上海证券交易所进行中央托管，投资者的上海股票可在任何一家券商进行交易，为保证投资者的股票安全，上交所推出“指定交易”服务，就是由投资者自愿选定一家券商，限定其上海股票交易只在此家券商交易，不能在除此外第二家券商交易，以防止其股票在其它券商被盗卖，保证其股票安全。“指定交易”只可指定唯一的一家券商，若重新在第二家“指定交易”，必须在原“指定”券商办理“指定撤销”后，方可在第二家券商办理“指定交易”。此种指定交易随时可以办理，也可随时撤销。
办理指定交易的好处：
股票安全性加强：如果投资者的上海股票帐户丢失，只需到指定券商处办理挂失，就会保证其股票安全；否则，他人拾到，可到其它任意一家券商抛出套现。
上海股票红利自动到帐：办理了指定交易，如果投资者的某只上海股票红利在挂牌期间未领，上海证券交易所会在该红利挂牌的最后一天自动派到投资者帐户，投资者不用办理任何手续；否则，投资者要到证券登记公司或指定的地点补领。
可享受上交所发送的股票对帐：对于办理了指定交易的帐户，可在上交所不定期发送对帐数据的次交易日在指定券商处查到上海股票余额。上交所不发送未指定交易帐户的股票余额，只可到证券登记公司申请查询。
防止他人误指定：已办理指定交易的帐户，不可能被其它投资者误指定。而未办理指定交易的帐户，有可能因为其它原因的误指定而被锁定股票，造成无法正常交易。
凡已开立上海股票帐户的投资者，均可在券商处利用交易系统委托办理，其委托方式如下：买卖方向为“买入”，代码为“799999”，价格为“1”，数量为“1”。次交易日办理交割确认，指定交易会在指定次日生效。
股票如何撮合成交
证券经营机构受理投资者的买卖委托后，应即刻将信息按时间先后顺序传送到交易所主机，公开申报竞价。股票申报竞价时，可依有关规定采用集合竞价或连续竞价方式进行，交易所的撮合大机将按“价格优先，时间优先”的原则自动撮合成交。
目前，沪、深两家交易所均存在集合竞价和连续竞价方式。上午9:15--9:25为集合竞价时间，其余交易时间均为连续竞价时间。在集合竞价期间内，交易所的自动撮合系统只储存而不撮合，当申报竞价时间一结束，撮合系统将根据集合竞价原则，产生该股票的当日开盘价。沪、深新股挂牌交易的第一天不受涨跌幅10％的限制，但深市新股上市当日集合竞价时，其委托竞价不能超过新股发行价的上下15元，否则，该竞价在集合竞价中作无效处理，只可参与随后的连续竞价。
集合竞价结束后，就进入连续竞价时间，即9:30-11:30和13:00--15:00。投资者的买卖指令进入交易所主机后，撮合系统将按“价格优先，时间优先”的原则进行自动撮合，同一价位时，以时间先后顺序依次撮合。在撮合成交时，股票成交价格的决定原则为：⒈成交价格的范围必须在昨收盘价的上下10％以内；⒉最高买入申报与最高卖出申报相同的价位；⒊如买（卖）方的申报价格高（低）于卖（买）方的申报价格时，采用双方申报价格的平均价位。交易所主机撮合成交的，主机将成交信息即刻回报到券商处，供投资者查询。未成交的或部分成交的，投资者有权撤消自己的委托或继续等待成交，一般委托有效期为一天。
另外，深市股票的收盘价不是该股票当日的最后一笔的成交价，而是该股票当日有成交的最后一分钟的成交金额除以成交量而得。
